安房にやってきた霊巖は、旧知の豪譽九把（ごうよきゅうは）上人が住職をしていた、北条（館山市）の金台寺（こんたいじ）に落着いて、民衆教化に励みました。中央の無双の学匠の説法ということで、人々が雲集（うんじゅう）し、大変な賑わいだったそうです。安房の国主里見氏9代義康は、伯父に当たるという豪譽から、このことを聞き、大網一村一円に東の山を添えて、永世寺領として32石を寄進したので、ここに仏法山大網寺大巖院（ぶっぽうさんおおあみじだいがんいん）の仮の堂が造られました。
国主の勧めで、東條民部左衛門（みんぶさえもん）や、近藤九郎右衛門尉（くろううえもんのじょう）ら、家中の上席がみな霊巖に帰依（きえ）することになります。いまも近藤九郎右衛門尉が寄進した大巖院の寺号（じごう）扁額が伝来しています。後に天津山より材木を切り出して、諸堂も造営され、やがて15間と13間の大本堂が落成しました。この年50歳になった霊巖は、鎌倉より仏師を招き、等身の寿像（じゅぞう）（霊巖像）を作らせ、門弟への形見、末代永く念仏信者への結縁（けちえん）としたといいます。
慶長13年（1608）上総国五井の領主松平紀伊守家信は、霊巖を理安寺（りあんじ）（後の清昌院守永寺（しゅえいじ）の開山として請じました。大巖院に伝わる夫妻の授戒像（じゅかいぞう）の体内には、この年の11月の墨書があります。里見義康の跡を継いだ10代忠義も、2年後の慶長15年（1610）3月に、霊巖より円頓戒（えんどんかい）を授かり、その法礼として朱印をもって寺領を42石にしたといいます。
霊巖の徳を慕う上総国佐貫城の内藤佐馬助（さまのすけ）政長は、佐貫の善昌寺へ転住して欲しいと懇請しました。霊巖は仏法を広めるため、これを承諾し、名残を惜しむ安房の人々に別れを告げました。
元和元年（1615）には、上総国湊村（かずさのくにみなとむら）に湊済寺（そうさいじ）を建立。同国小糸市宿に三経寺（さんきょうじ）を、また姉ヶ崎の最頂寺（さいちょうじ）を改宗。下湯江に法巖寺（ほうがんじ）を起立（きりゅう）と、次々に寺院を再興、創建しています。
この年8月、宗祖円光大師法然（ほうねん）上人の遺跡（ゆいしゃく）・霊場の巡拝（じゅんぱい）を発願（ほつがん）し旅立ちました。この旅行の4年間に結縁（けちえん）の血脈（けちみゃく）は数万人に及び、30カ寺の寺院を興して、佐貫に帰ってきました。
この頃には諸候や旗本などで霊巖に帰依渇仰（きえかつごう）し、江戸へ招く人が多くなってきました。そのたびごとに房総から出かけて行って、説法をしていたのですが、茅場町の辺りに結んだ仮の草庵（そうあん）も、日増しに群集（ぐんしゅう）して狭くなってしまいました。それを何とかしようと、堀庄兵衛という人が、北続きの沼を旗本向井将監（しょうげん）から譲り受け、江戸における霊巖の伝道地にしようとしました。信者たちは手に手に土石を持ち寄って、先を争うように埋め立てたので、瞬く間に立派な平地になったといいます。こうしてできた東西1町余、南北2町余の敷地が、霊巖（岸）島の起こりです。現在の中央区新川1～2丁目にあたります。
元和7年（1621）、房総との交通の要所に、数百人容れることのできる仮屋が設けられたのが、有名な霊巖寺の草創となります。霊巖にはたくさんの弟子がいましたが、諸国に所化（しょけ）（学僧）を留めて置いていました。それを呼び集めるため、まず学寮を建てようと考えました。材木の寄付を呼びかけたところ、房総のそこかしこから、信者たちによる寄付の材木が大船に積まれ運ばれて来たそうです。こうして、寛永6年（1629）秋、本堂、諸堂、学寮建ち並ぶ霊巖寺が見事に完成し、新たに十八檀林の一つとして認められました。
れいがん橋（東京都中央区新川）